Université « Ziane Achour » de Djelfa, Faculté SNV, Dep. de Biologie, M1 Biotechnologies Végétales
Liste des travaux pratiques (practical works, PWs) à préparer à domicile et à remettre pour l’évaluation du TP de Génomique Végétale (M1 Biotechnologies végétales)
S1, 2020
M. Belaouni Hadj Ahmed, responsable du module de Génomique Végétale
- Instructions :
Chaque PW devra être préparé sous forme de rapports (3), séparément, en anglais, à partir du document mis en ligne (plant genomics PW). Vous avez 3 PWs (3 rapports), chacun concerne une partie du document mis en ligne, et dans chacun vous devez mentionner :
- La page de garde : nom, prénom, promotion, spécialité, nom du module, numéro du PW.
- Deuxième page : ré-écrire les sections (parties) du PW en question (voir la liste suivante en bas).
- Reste des pages : écrire chaque section, et votre réponse succincte (brève) directement après la section en question. La procédure à suivre pour chaque PW est détaillée dans le document mis en ligne.
Autres indications importantes :
- N’oubliez pas de numéroter les pages.
- Vous avez le choix entre un rapport préparé avec ordinateur, ou écrit à la main (je préfère à la main).
- Les travaux sont individuels. Les réponses « copiées-collées » annulent la note pour toutes les personnes concernées. Choisissez vos génomes et gènes de manière individuelle.
- La langue de réponse devra être en anglais.
- Les procédures exactes pour la préparation des rapports se trouvent dans le document mis en ligne.
- Je ramasserai les PW entre le 18 et le 20 Octobre 2020. Dans le cas ou vous n’arrivez pas à me trouver, veuillez les déposer au niveau du département, durant la mâtiné (bureau du chef de département).
- Aucun rapport ne sera accepté en dehors du délai établi.
- Voici mon adresse mail si vous avez besoin de plus de détails : shoober5@yahoo.fr
2. Voici les taches à préparer pour chaque PW (rapport):
PW1
• Presentation of the plant GDB (from the « about » section)
• Presentation of the database project objectives
• The content of the outreach section (from the sitemap page)
PW2
• Select one of the plants available in the genome browsers
• Display the summary table for your selected genome, copy and paste it in your report with the its title
• Go to visualization of one of its chromosomes, screenshot the
displayed diagram, and put it in the report with its legends.
• Select one gene, and highlight its annotation by moving the cursor on it (without clicking), and screenshot it, past it in your report.
PW3
- § Select 3 genes from your selected genome (PW2)
- § Screenshot the diagram of each gene from the overview window, paste it in your report.
- § Present each gene, giving the following information:
• Its description (annotation) ; the name of the browser ; the gene ID (yrGATE-At4.00056 ); the name of the submitter ; The status of the proposed annotation contribution ; the last date it was modified
• The mRNA sequence
• The protein sequence
Bon courage
Djelfa le 01/10/2020